Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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