Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPD2Q15021 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms