Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCLAFQ15004 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms