Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGB1Q14028 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGB1Q14028 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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