Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDH18Q13634 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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