Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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IRF5Q13568 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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IRF5Q13568 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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IRF5Q13568 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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IRF5Q13568 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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