Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms