Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSG1Q02413 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms