Protein–RNA interactions for Protein: Q01955

COL4A3, Collagen alpha-3(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3Q01955 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A3Q01955 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms