Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms