Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGDP52209 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGDP52209 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGDP52209 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGDP52209 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGDP52209 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms