Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRIM1P49642 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM1P49642 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms