Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYB561P49447 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYB561P49447 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYB561P49447 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms