Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTRNP46939 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UTRNP46939 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
UTRNP46939 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
UTRNP46939 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UTRNP46939 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTRNP46939 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms