Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRXP46100 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRXP46100 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms