Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP6P35125 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP6P35125 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP6P35125 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP6P35125 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP6P35125 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP6P35125 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms