Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms