Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCKARP32238 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCKARP32238 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCKARP32238 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms