Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA7P31268 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms