Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR2AP24928 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms