Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1P21675 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1P21675 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1P21675 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF1P21675 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TAF1P21675 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TAF1P21675 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1P21675 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1P21675 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1P21675 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1P21675 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms