Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NF1P21359 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NF1P21359 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NF1P21359 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NF1P21359 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms