Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP4AP20648 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP4AP20648 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms