Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCNA2P20248 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCNA2P20248 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms