Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRFP10586 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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