Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms