Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB3P05106 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms