Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYCNP04198 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYCNP04198 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYCNP04198 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYCNP04198 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYCNP04198 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms