Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM37O94972 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM37O94972 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms