Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN7O94888 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms