Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCTN3O75935 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms