Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD4O60885 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD4O60885 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD4O60885 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms