Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSPAN2O60636 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms