Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNC1O60486 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms