Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPAG9O60271 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPAG9O60271 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms