Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01387J3KSC0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms