Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B4DGG1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B4DGG1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4DGG1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4DGG1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms