Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT87PA6NCN2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms