Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMB4A4D0S4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMB4A4D0S4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms