Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN8AQ9UQD0 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SCN8AQ9UQD0 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN8AQ9UQD0 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SCN8AQ9UQD0 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
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SCN8AQ9UQD0 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
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SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
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