Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ALX1Q15699 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
ALX1Q15699 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ALX1Q15699 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ALX1Q15699 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ALX1Q15699 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
ALX1Q15699 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
ALX1Q15699 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
ALX1Q15699 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.48□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.53□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
ALX1Q15699 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.56□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
ALX1Q15699 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
ALX1Q15699 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ALX1Q15699 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ALX1Q15699 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ALX1Q15699 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
ALX1Q15699 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ALX1Q15699 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ALX1Q15699 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ALX1Q15699 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ALX1Q15699 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ALX1Q15699 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ALX1Q15699 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ALX1Q15699 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
ALX1Q15699 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
ALX1Q15699 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
ALX1Q15699 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ALX1Q15699 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ALX1Q15699 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
ALX1Q15699 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ALX1Q15699 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ALX1Q15699 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
ALX1Q15699 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
ALX1Q15699 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
ALX1Q15699 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ALX1Q15699 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ALX1Q15699 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
ALX1Q15699 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ALX1Q15699 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ALX1Q15699 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
ALX1Q15699 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-3.75□□□□□ -3.01
ALX1Q15699 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
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