Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
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CLDN9O95484 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CLDN9O95484 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
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CLDN9O95484 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CLDN9O95484 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CLDN9O95484 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
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CLDN9O95484 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
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CLDN9O95484 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
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CLDN9O95484 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CLDN9O95484 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
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CLDN9O95484 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CLDN9O95484 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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CLDN9O95484 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CLDN9O95484 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
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CLDN9O95484 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
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CLDN9O95484 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
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CLDN9O95484 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CLDN9O95484 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CLDN9O95484 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
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CLDN9O95484 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
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CLDN9O95484 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
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