Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-4.05□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
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