Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-4.13□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-4.13□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
SHPRHQ149N8 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-4.18□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-4.2□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SHPRHQ149N8 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SHPRHQ149N8 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.32□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
SHPRHQ149N8 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-4.35□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
SHPRHQ149N8 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
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