Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CDO1Q16878 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CDO1Q16878 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CDO1Q16878 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CDO1Q16878 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CDO1Q16878 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.4 ms