Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
U3KQ87 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
U3KQ87 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
U3KQ87 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
U3KQ87 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms