Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP3Q9Y6F1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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