Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARFGEF1Q9Y6D6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms