Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms