Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms